表題のとおりです．
名前は出オチです (ref: エニグマ (暗号機) - Wikipedia)
色々あってgpgコマンドが無い (入れられない) ような環境でもバイト列を暗号化・復号化したいということがあり (あと脳が悪くてgpgコマンドのオプションを覚えられない)，バイナリぽん置きでそれをやるツールを書いたという話です．使い方についてはREADMEをご覧ください．至ってシンプル．
もちろんgpgコマンドとの互換性もあるので，gpgでencryptしたファイルをamugineでdecryptしたり，あるいはその逆をすることも可能となっています．
golangはopenpgpの実装をgolang orgで提供しているので大変便利ですね！ https://github.com/golang/crypto/tree/master/openpgp
